蛋白质序列-蛋白质序列数据库

大家好，今天小编关注到一个比较有意思的话题，就是关于蛋白质序列的问题，于是小编就整理了5个相关介绍蛋白质序列的解答，让我们一起看看吧。

内质网输出的蛋白质没有信号序列？

没有

研究发现，核糖体合成的分泌蛋白有信号序列，而从内质网输出的蛋白质不含信号序列

首先分析蛋白质的合成位置：在核糖体合成，内质网/高尔基体进行加工。

核糖体、高尔基体和内质网这三个细胞器都在细胞质基质，所以一个蛋白质假如没有信号序列，那么它只能停留在细胞质基质中

如何判断一段DNA序列是否可能编码一个多肽或蛋白质？

先用blast网站搜索一下，找到相似性比较高的序列，如果该序列编码一个蛋白的话，就是基因； 如果上述方案行不通的话，就要从头预测了。需要对其注释，预测其是否含ORF，启动子之类的。

怎么找基因序列？

在NCBI上面找在上边查找基因序列方法是： 首先打开NCBI网站首页，然后在search一栏中选择nucleotide，在框中输入要的基因序列名称，点击search就行。

然后会出来很多结果，因为很多基因是同名的，或是一个基因在不同种属中不一样，寻找要的基因序列就行了。注意的是，要确定基因名称是否是统一的，找到基因序列，蛋白序列就很容易了，因为结果中会显示该基因的蛋白序列。

可以在开始search的时候选protein，找到的就是蛋白序列了。

在linux中如何建蛋白序列数据库

使用create命令建立mysql数据库: 新建数据库例：

1.以mysql最高管理员登录，在mysql>create database XXXXX; xxxxx即为数据库名. 2.在mysql中如何创建用户,使该用户对该数据库有完全权限. 3.可 以 用 GRANT 命 令 ， 格 式 如 下 : GRANT 许可权 ON 数据库名.表名 TO 新用户名@主机名 IDENTIFIED BY '密码'; grant all on husidb.* to john@localhost identified by ’201314’; 注:每一句mysql语句后面都跟有;号.注意大小写.

什么叫种子序列？

种子序列即其它物种中此基因的序列。

通过数据检索我们会获得候选蛋白的ID，根据此ID从数据库中提取相应序列

棉花的序列可以直接根据ID从面棉花在线数据库中提取出来，很是方便。此时我们有了候选蛋白序列，之后通过NCBI-CDD，Pfam，KEGG等数据库对候选蛋白进行检验，从而确定其基因家族成员。

到此，以上就是小编对于蛋白质序列的问题就介绍到这了，希望介绍关于蛋白质序列的5点解答对大家有用。